ORCHIDSプロジェクトでは、海洋基礎科学部門と海洋応用科学部門にそれぞれ2つの研究分野を設置してそれぞれの研究を展開する。加えて、学外機関との連携基盤を確立し、分野横断的プロジェクト研究を推進する。

また、本学教職員を海外研修や調査等のために国内外に派遣したり、国内外から研究者を招へいしたりすることで、国内外の海洋科学研究者（研究機関）とのグローカルネットワークの構築を奨励する。